Avrupa futbolunun kulüp düzeyindeki iki numaralı organizasyonunda lig aşamasının kura çekimi, Monako'daki Grimaldo Forum'da gerçekleştirildi.
Fenerbahçe, UEFA Avrupa Ligi'nde Slavia Prag, Manchester United, Lyon, AZ Alkmaar, Union Saint-Gilloise, Midtjylland, Atletico Bilbao ve Twente ile eşleşti.
Bu sezon yeni formatında 36 takımla oynanacak olan UEFA Avrupa Ligi’nde 2024-2025 sezonu final maçı 21 Mayıs 2025 Çarşamba günü İspanya’nın Bilbao kentinde bulunan San Mames Stadyumu’nda oynanacak.